Grant COVID-19 kankeronderzoek

Vaccinatie tegen SARS-CoV-2 kan de immuunrespons tegen COVID-19 versterken, maar er is ook aangetoond dat kankerpatiënten een zwakker immuunantwoord veroorzaken op basis van antilichamen. Het is duidelijk dat T-celimmuniteit essentieel is voor bescherming tegen ernstige COVID-19 en dat deze ook kan worden opgewekt door vaccinatie, hoewel veel minder gekarakteriseerd en begrepen. Het doel van deze studie is om diepgaande longitudinale vaccin-geïnduceerde T-celsignaturen te bepalen van een unieke staalcollectie van kankerpatiënten die vier dosissen SARS-CoV-2 vaccin kregen gedurende 14 maanden (B/Tri-voice cohorten, BelCoVac consortium), en te evalueren of deze overeenkomen of verschillen met wat klinisch en in het humorale compartiment kan worden waargenomen.

De complexiteit van T-celimmuniteit vereist een geavanceerde multi-omics aanpak. Single-cell multiparametrische flowcytometrie (FCM) en high-throughput T-cel receptor repertoire sequencing zijn cruciale methoden om immuunsignaturen te ontrafelen op respectievelijk eiwit- en genniveau. Beide methoden genereren big data, wat gespecialiseerde computationele modellen, zoals automatische selectie en clusteralgoritmen voor FCM en sequencing data, essentieel maakt om de enorme hoeveelheden informatie volledig te decoderen. Dit onderzoek zal essentieel zijn om ons inzicht in de adaptieve T-celreacties op COVID-19 uit te breiden en om te helpen bij het uitwerken van vaccinatiestrategieën voor de meest kwetsbare bevolkingsgroepen tijdens toekomstige pandemieën.